A SMT, Secretaria Municipal de Transportes, é o órgão da Prefeitura de São Paulo responsável por todos os assuntos relacionados ao gerenciamento da operação do sistema viário e ao transporte público na cidade. A estrutura da SMT inclui um Departamento de Operações do Sistema Viário (DSV) e um Departamento de Transportes Públicos (DTP), a quem compete os serviços de ônibus, táxis e correlatos.

A São Paulo Transporte S.A. - SPTrans, sucessora da tradicional Companhia Municipal de Transportes Coletivos - CMTC -, a partir de 1995, exerce o gerenciamento técnico e operacional do Sistema de Transporte Urbano, permanecendo com a Prefeitura, através da Secretaria Municipal de Transportes, as decisões finais de nível institucional.

A estrutura organizacional da empresa estabeleceu um quadro funcional integrado, distribuído em poucos níveis hierárquicos, formado, em sua maioria, por técnicos e especialistas.

As atribuições da empresa estão divididas em seis Diretorias Executivas - Diretoria da Presidência, Diretoria de Serviços de Transporte, Diretoria de Infra-Estrutura, Diretoria de Planejamento de Transportes e de Gestão Corporativa, Diretoria Adjunta de Gestão de Tecnologia da Informação e Receita, Diretoria Adjunta de Gestão do Sistema Contratado, e uma diretoria de representação - a Diretoria de Relações Internas.